Mittlerweile habe ich das Problem gelöst bekommen. Ich weiß nicht ob es auf alle zutrifft, aber vielleicht hilft es dem einen oder anderen.
Es schien bei mir daran zu liegen, dass ich nur D-A-CH Karten auf 2017 geupdated habe. Der Rest ist immer noch auf Stand 2016. Dadurch werden die "komplett EU POI Dateien" anscheinend nicht richtig erkannt. Bei mir ging er jedes mal mit einem Lesefehler wieder raus. Ich habe jetzt das Ganze nochmal nur mit D-A-CH POI probiert und siehe da, es funktioniert endlich.
Vielen Dank für deine Arbeit.