Glück Auf,
bei meinen 3.0 TDI Quattro 2008, war es vor 2 Jahren das Bypassthermostat oder Bypassventil am AGR-Kühler.
Ähnliche Symptome, sehr lang gebraucht um auf 90°C zu kommen und bei Talfahrt sogar Temperaturabfall.
Ich hatte auch erst das Thermostat am Motorblock getauscht, aber hatte nichts geändert.
Ich kann nur nicht sagen bei welchen Motoren dieses Ventil verbaut wurde.