Für mich klingt das nach dem bekannten Problem mit dem Zahnriemen bzw der Spannrolle. Bei VW werden die Hersteller von Zahnriemen und Spannrolle geprüft und dann im Bedarfsfall entweder nur die Rolle bzw der Zahnriemen oder beides zusammen getauscht. Wie Skoda das handhabt weiß ich leider nicht.
Verschwindet das Geräusch wenn der Motor betriebswarm ist?
P.S. : ich habe den Beitrag mal ins richtige Unterforum verschoben